Okulumuz 1990-1991 Öğretim yılında ilçemiz Mermer mahallesinde bir katlı, 5 dershaneli MERMER İLKOKULU adıyla açılmıştır. Mermer mahallesinde yapılan kooperatif evlerinin tamamlanması ve yerleşimle beraber nüfusun hızla artması mahallede en kısa sürede bir İlkokulun açılmasını gerektirmiştir.
Çankırı Valiliği’nin girişimiyle yapılan okul; açıldığı yılda 85 öğrencisi, 5 öğretmeni ve 1 geçici hizmetlisi ile eğitim-öğretime başlamıştır. Isınma sobayla gerçekleştirilmekteydi. Çevre düzenlemesi yoktu. 1995 yılında okulun 2 katı ve ek olarak kalorifer dairesi yapılarak 10 dershaneli İlköğretim Okuluna dönüştürülmüştür.
Adı MERMER İLKÖĞRETİM OKULU olmuştur. Okulumuzun adı ilçemiz halkından Hasan EKEN´in oğlu İsa EKEN, Siirt İli Pervari ilçesinde askerlik görevi sırasında şehit olması ile 29 NİSAN 1999 yılında Karabük Valiliği´nin 700/6299 sayılı olurları ile ŞEHİT İSA EKEN İLKÖĞRETİM OKULU olarak değiştirilmiştir. 2012 yılında 4+4 eğitim sitemine geçilmesi ile birlikte okulumuza 12 derslikli yeni binasına taşınmış ve adı Mermer Ortaokulu olarak değiştirilmiştir. Halen Mermer Ortaokulu olarak eğitim öğretime devam etmektedir.